Геннадий Муратшин родился в 1935 г. в Свердловске.
Трудовую деятельность начал в 1953 г. по окончании Свердловского электромеханического техникума в КБ завода «Уралэлектроаппарат». Работу на заводе совмещал с учебой в УПИ.
После окончания в 1958 г. радиотехнического факультета работал в ОКБ машиностроительного завода им. Калинина в научно-исследовательском отделе инженером, ведущим инженером, заместителем начальника отдела; возглавлял направление математического и полунатурного моделирования. Разработал аналого-цифровой вычислительный комплекс, выполнил большой объем лабораторных исследований по отработке бортовых систем для зенитных и противолодочных ракет, в т. ч. по применению (впервые в отечественной практике) ЦВМ на ракетах комплекса ПВО (С-3ООВ).
В 1975-1986 гг. работал главным инженером СМКБ «Новатор», при его участии создана уникальная вычислительная и лабораторно-стендовая база, построен инженерный корпус, разработана и реализована система наземной отработки создаваемых ракет, сокращены затраты и сроки полигонных испытаний.В 1986 г. назначен главным конструктором НПО «Старт». Спроектированы, изготовлены и сданы на вооружение десятки образцов новой техники для ракетных комплексов сухопутных войск, авиации и ВМФ. Только для запуска первого в мире космического челнока «Буран» «Стартом» была обеспечена разработка и поставка свыше 80 единиц наземного оборудования.
В начале 90-х гг. закончил Высшую коммерческую школу при АНХ СССР, прошел стажировку в экономическом семинаре Нобелевского лауреата Леонтьева В.В., затем в Кентском и Пеппердайнском университетах (США) по вопросам менеджмента и маркетинга.
В годы развала ВПК под его руководством разработан и осуществлен комплекс мер, обеспечивших сохранение научно-технического и производственного потенциала «Старта». Реализована «Программа конверсии предприятия», создано свыше 70 образцов оборудования для лесопромышленного и нефтяного комплексов, металлургической, пищевой промышленности, медицины и др.
Начиная с 1995 г. в результате активной и целенаправленной работы Г.М. Муратшина ОАО НПП вышло на международный рынок и постоянно расширяет номенклатуру экспортных заказов.
Ведет активную работу в сфере международного сотрудничества по гражданской продукции. Во многом благодаря его активной работе стало возможным соглашение о совместном производстве китайских автомобилей на заводе «Амур», разработана программа совместного (с китайскими фирмами) производства высокотехнологичного медицинского оборудования на предприятиях ОПК области.
Награжден медалью «За доблестный труд» в ознаменование 100-летия со дня рождения В.И. Ленина. (1970), орденом «Знак Почета» (1982), медалью «300 лет Российскому Флоту» (1996), орденом «За заслуги перед Отечеством» IV степени (1999), имеет звание «Заслуженный машиностроитель РФ» (1995), многочисленные отраслевые и правительственные премии и награды. Член-корреспондент Российской академии ракетных и артиллерийских наук; действительный член Международной академии реальной экономики, действительный член Международной академии лидерства в бизнесе и управлении; член Совета главных конструкторов по кора6ельным зенитно-ракетным комплексам и системам; член президиума Союза оборонных предприятий Свердловской области.
Автор 24 изобретений и свыше 60 печатных работ.